Новости и объявления

В масштабном FLOSS-проекте по биоинформатике Bioconductor зарегистрирован пакет компьютерных программ ORFhunteR

Программный пакет разработан сотрудниками кафедры генетики (В. В. Гринев), а также кафедры системного анализа и компьютерного моделирования (Н. Н. Яцков, В. В. Скакун, М. К. Чепелева) Белорусского государственного университета в кооперации с Департаментом онкологии (П. В. Назаров) Люксембургского института здоровья.

Ключевой задачей, решаемой с помощью ORFhunteR, является автоматическое обнаружение и аннотирование открытых рамок считывания в больших наборах сиквенсов РНК человека, реконструируемых по данным полнотранскриптомного секвенирования (отсюда и название ORFhunteR – identification of the Open Reading Frames by hunting with R codes). В основу решения такой задачи положены алгоритмы интеллектуального анализа данных (Data Mining) и машинного обучения (Machine Learning).

Более подробное описание разработки приведено в препринте статьи «Grinev V. V., Yatskou M. M., Skakun V. V., Chepeleva M. K., Nazarov P. V. ORFhunteR: an accurate approach for the automatic identification and annotation of open reading frames in human mRNA molecules», опубликованной в bioRxiv от Cold Spring Harbor Laboratory (biorxiv.org/content/10.1101/2021.02.05.429963v1). Следует отметить, что это первая разработка белорусских ученых, связанная с биоинформатикой, которая была зарегистрирована в проекте такого уровня: инициатива Bioconductor является признанным мировым лидером в области Open Source Software for Bioinformatics.